解決黑臭水體問題涉及自然科學、工程技術、社會科學、經濟學和管理科學，需要針對黑臭水體進行跨學科的、涉及生態、社會、經濟等各方面的研究。根據國內外研究進展以及熱點趨勢，未來黑臭水體治理技術的發展趨勢需滿足治理效果穩定可靠、運行經濟合理、已有應用實例等要求，涉及的污染源控制、生態修復與監管新技術主要包括以下幾個方面。 

在點源治理方面，以應用脫氮、脫碳、除磷及資源、能源化先導技術為主，如真空收集截污技術、氮磷及有價物質回收利用技術、難降解工業廢水氧化技術等。 

在面源治理方面，需集成應用城市面源綜合協同控制技術，初期雨水、地表漫流截流與污染控制技術等。 

在內源治理方面，以研發應用新材料與制劑為主，如氧化劑、覆蓋劑、生物抑制劑、環境友好生態覆蓋劑等。 

在生態修復方面，應以應用原位水質改善及生物生態恢復技術為主，如復合酶原位生態凈化、復合微生物菌劑、土著微生物擴增及生物促生、生物操縱等技術。 

目前我國大部分城市地表水由于污染日趨嚴重已經演變成黑臭水體。

 主要治理河流黑臭的技術和方法包括物理法、化學法和生物法，其中由于生物修復具有環境友好、生態節能等優點，在黑臭河流的治理中得到了廣泛的應用。另外，在原有物理、化學和生物技術的基礎發展、組合和延伸一系列新技術也有著廣闊的發展前景。國內外對黑臭河流的治理研究已有了一定的成效，并且建立了相關的水質指數關系式以及預測模型。今后，黑臭水體治理以及組合技術的推廣將擁有更加廣闊的前景。